中國農(nóng)科院茶葉所通過基因組鑒定與表達(dá)譜分析揭示MBD家族蛋白調(diào)控茶樹脅迫應(yīng)答和生長發(fā)育的多重作用
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中國農(nóng)科院茶葉所通過基因組鑒定與表達(dá)譜分析揭示MBD家族蛋白調(diào)控茶樹脅迫應(yīng)答和生長發(fā)育的多重作用

茶樹是多年生木本經(jīng)濟(jì)作物,其生長發(fā)育調(diào)控及逆境脅迫響應(yīng)的分子機(jī)制一直是茶樹生物學(xué)研究的重點(diǎn)和熱點(diǎn)領(lǐng)域之一。DNA甲基化和去甲基化是表觀遺傳修飾的重要方式,可通過與轉(zhuǎn)錄因子的相互作用或改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)來調(diào)控基因的表達(dá)。隨著越來越多的植物基因組被破譯和高精度甲基化組學(xué)分析的實(shí)現(xiàn),DNA甲基化在植物生長發(fā)育以及應(yīng)對環(huán)境脅迫中的作用機(jī)制不斷被揭示。

甲基化CpG結(jié)合域(methyl-CpG-binding domain, MBD)蛋白是一類重要的甲基化譯碼蛋白,它們能夠特異性識別并結(jié)合至基因組的甲基化CpG位點(diǎn),通過募集其他阻遏因子或者抗沉默因子形成復(fù)合物,引起結(jié)合區(qū)染色質(zhì)的修飾改變與結(jié)構(gòu)重塑,進(jìn)而產(chǎn)生基因轉(zhuǎn)錄的抑制或激活作用。但在木本植物中與甲基化DNA識別調(diào)控相關(guān)的基因鑒定及其與植物生長發(fā)育、逆境響應(yīng)的研究還鮮有報道。

近期Beverage Plant Research在線發(fā)表了中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所茶樹遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)題為Genome-Wide Identification and Expression Profiling Reveal the Diverse Role of Methyl-CpG-Binding Domain Proteins in the Tea Plant Camellia sinensis的研究論文。

該研究利用茶樹基因組數(shù)據(jù)共鑒定到16個MBD家族基因。表達(dá)譜分析顯示,在生物脅迫和非生物脅迫下,多數(shù)CsMBDs基因均不同程度被誘導(dǎo),且在茶樹芽和花的不同發(fā)育階段以及種子的不同萌發(fā)階段表達(dá)有差異。其中有參與生物脅迫和芽休眠調(diào)控的CsMBD8,參與非生物脅迫調(diào)控的CsMBD5,和參與種子萌發(fā)調(diào)控的CsMBD2等。該研究為深入解析表觀遺傳調(diào)控茶樹生長發(fā)育和逆境響應(yīng)提供了重要信息。

圖1 茶樹中MBD蛋白家族的進(jìn)化樹分析

圖2 非生物脅迫下茶樹中15個CsMBD基因的相對表達(dá)量

圖3 茶樹中15個CsMBD基因在生長發(fā)育過程中的表達(dá)模式

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所博士研究生陳瑤和福建農(nóng)林大學(xué)碩士研究生李宇騰為該論文的共同第一作者,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所楊亞軍研究員和郝心愿副研究員為共同通訊作者。該研究得到了國家自然科學(xué)基金(31972461)、國家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目(2018YFD1000601)、國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)(茶葉)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-1901A)和中國農(nóng)科院創(chuàng)新工程(CAAS-ASTIP-2017-TRICAAS)的資助。

來源:Maximum學(xué)術(shù)出版 ,作者M(jìn)AP

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